天麻种子的处理：选种：选取当年挖出的天麻，除去商品麻，把所有麻种选出再筛选，拣除烂麻、畸形麻等劣质麻种，最后确定为个头相当、健壮、外观整齐、个头大、成色好、无创伤的天麻作为次年使用的麻种。拌种：用新高脂膜10-50倍液拌种，防止病害侵入。将坑底挖松，整平后铺上一层阔叶树树叶及腐殖土，然后把事先准备好的木材均匀摆在坑底，材间距离6-8厘米，每窝放6-8根木材。栽时把密环菌枝紧靠放在木材两侧鱼鳞口处，再把天麻种子放在菌枝和木材处，以便使两者很快建立营养共生关系。之后把剩余的蜜环菌种分成黄豆大小的颗粒，均匀散放在木材中间。之后用腐殖土或细沙填平，轻轻压紧，不留空隙。若种子和菌种、菌枝数量多，可以在第一层上面再栽培一层，方法同上。但注意上、下木材方成”井“字形。最后在上面覆盖细土15厘米左右，天麻，盖枯枝落叶，成龟背形，略高于地面，半夏白术天麻汤，以利排水。
栽种种麻时，选用不漏水的容器装沙土最好，首先在盆底铺上5厘米沙土，然后将种麻直立放在盆中，盖上沙土，将块状茎完全覆盖为准，保持植株不倒就可以了，一般为10多厘米，种后要洒一次水，然后将盆移到室内，也可以用塑料薄膜在室内搭一个种植槽种植，作为种麻的乌天麻和红天麻在盆中种植的数量要大致相等，室内要求没有太阳直射光，阴凉透风，温度要在摄氏19度到30度之间，盆内要定期撒水，湿度要保持在60%到70%，不用肥料，这一阶段天麻种麻靠吸收自身体内储备的营养使花薹逐渐长高，从天麻的花薹可以看出乌天麻和红天麻的区别：红天麻抽出的薹偏红，乌天麻抽出的薹偏乌。花薹长到一米以上直接在薹上长出花苞，没有叶子，西峰天麻，不能进行光合作用。乌天麻开出的花呈淡绿色，红天麻开出的花呈水红色，天麻移种一个月后，天麻怎么吃，就可以进行人工授粉，乌红天麻就是将乌天麻的花粉授到红天麻的花柱头上，完成乌红杂交。
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