在正常运行条件下，反渗透膜也可能被无机物垢、胶体、微生物、金属氧化物等污染，反渗透设备供应，这些物质沉积在膜表面上会引起净水设备反渗透装置出力下降或脱盐率下降、压差升高，甚至对膜造成不可恢复的损伤，工业反渗透设备，因此，为了恢复良好的透水和除盐性能，需要对膜进行化学清洗。一般3～12个月清洗一次，如果每个月不得不清洗一次，渭南反渗透设备，这说明应该改善的预处理系统，调整的运行参数。如果1～3个月需要清洗一次，直饮水反渗透设备，则需要提高设备的运行水平，是否需要改进预处理系统较难判断。
反渗透设备中常见的问题是脱盐率的下降和产品水量的降低，如果二者或其中之一缓慢地降低，则可能是污垢或水垢产生的常见现象，反渗透设备可以通过适当的清洗来解决问题；而突然或快速的性能下降，则表明处理系统出了问题或操作失当。发生了问题，需要尽早解决，延误时机会导致反渗透膜无法恢复原有的性能。反渗透设备及时发现问题的先决条件是保存相应的记录。当发现系统脱盐率和产水量下降时，首先应该校正仪表，以避免因仪表原因而误判。这些仪表包括电导率表、流量表、压力表、温度表等。其次，要对记录的运行数据进行“标准化”。因温度、进水TDS、回收率、使用年限和水通量等发生变化，都会引起脱盐率和产水量的变化。
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