HSE管理体系主要问题：HSE管理体系存在的主要问题包括领导支持力不足、培训教育不完善、资金投入困难、组织机构及职责不明确、各部门不能很好配合、出现问题无反馈途径、外部监察力度不够、对法规或其它要求的合规性评价不足等等。例如过分重视书面文件，庆阳HSE认证，而对于实质性的本质安全、环保技术、惯例应用不够技术支持不完善，风险评价、清洁生产、应急准备与响应等方面落实不够；HSE体系与现有的安全环境管理“两张皮”现象全员参与意识差，以人为本、可持续发展的理念不能得到有效落实。在资源配置方面，人力资源配置不足，培训不够，基础设施良芳不齐目标管理方面只注重结果，忽视目标实现的过程管理在内部审核过程中提供证据对体系文件的执行力不够不进行目标分解，缺乏目标责任人和奖惩措施。
HSE管理体系结构特点1.按戴明模式建立。HSE管理体系是一个持续循环和不断改进的结构，HSE认证手续，即“计划—实施—检查—持续改进”的结构。2.由若干个要素组成。关键要素有：领导和承诺，方针和战略目标，组织机构、资源和文件，HSE认证机构，风险评估和管理，规划，实施和监测，评审和审核等。3.各要素不是孤立的。这些要素中，领导和承诺是核心；方针和战略目标是方向；组织机构、资源和文件作为支持；规划、实施、检查、改进是循环链过程。辅助方法和工具是为有效实施管理体系而设计的一些分析、统计方法。由以上分析可以看出：（1）各要素有一定的相对独立性，分别构成了核心、基础条件、循环链的各个环节；（2）各要素又是密切相关的，任何一个要素的改变必须考虑到对其他要素的影响，以保证体系的一致性；（3）各要素都有深刻的内涵，大部分有多个二级要素。
HSE实施程序文件的编制：HSE实施程序是HSE管理体系可执行文件的集合，根据集团公司HSE管理体系和HSE管理规范的要求，企业及二级单位在建立HSE管理体系前，应编制《企业HSE管理体系实施程序》，《职能部门HSE职责实施计划》、《生产车间（装置）HSE实施程序》3种HSE实施程序文件。
